RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 SETD9Q8NE22 299 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GRHL3Q8TE85 626 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM239Q8WW34 195 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PSMF1Q92530 271 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OSTF1Q92882 214 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ITFG2Q969R8 447 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DDIT4LQ96D03 193 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 APOL4Q9BPW4 351 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RLIMQ9NVW2 624 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RAB26Q9ULW5 256 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MED13Q9UHV7 2174 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0B4J2E0 115 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GWA3 101 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GX12 115 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 M0R3H8 397 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SEC14L5O43304 696 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SCO2O43819 266 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IDH3BO43837 385 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NME2P1O60361 137 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 C1QCP02747 245 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HMGN1P05114 100 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 BMP7P18075 431 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IGFBP5P24593 272 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FPR3P25089 353 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SRD5A2P31213 254 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RYKP34925 604 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF136P52737 540 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GAS1P54826 345 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CTBP2P56545 445 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRPS1P60891 318 aa6.65□□□□□ -1.34
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SMAD4-210ENST00000590061 TLE3Q04726 772 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 Q0VFX4 171 aa6.65□□□□□ -1.34
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SMAD4-210ENST00000590061 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 QPRTQ15274 297 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT10Q86SR1 603 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CBR4Q8N4T8 237 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FADS6Q8N9I5 356 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GPR119Q8TDV5 335 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 UCK2Q9BZX2 261 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KRT84Q9NSB2 600 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 LUZP4Q9P127 313 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DKKL1Q9UK85 242 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD4-210ENST00000590061 A6NL46 340 aa6.64□□□□□ -1.35
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