RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FN3K	Q9H479	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGU	Q9H490	435 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BPTF	Q12830	3046 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		A1L4Q6	167 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		J3KTA2	159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		J3QRK9	145 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		K7EQS6	105 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PGRMC2	O15173	223 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKY	O43930	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	COQ9	O75208	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR75	O95800	540 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AIFM1	O95831	613 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PTH	P01270	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GRP	P07492	148 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PF4V1	P10720	104 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXB2	P14652	356 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	F8A1	P23610	371 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP11	P24347	488 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRA5	P31644	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IDUA	P35475	653 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RABIF	P47224	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9A3	P48764	834 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CCR5	P51681	352 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	METAP1	P53582	386 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ADPRH	P54922	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CASP9	P55211	416 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TAS2R43	P59537	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BTN3A2	P78410	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SYPL1	Q16563	259 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74

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