RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580262.2

MYO15B-216, Transcript of myosin XVB, human

TSL 3

Gene MYO15B, Length 707 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYO15B-216	ENST00000580262	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	ALDH3A2	P51648	485 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	IST1	P53990	364 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	NUP107	P57740	925 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	IL1RL1	Q01638	556 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	DAG1	Q14118	895 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	RFX4	Q33E94	735 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	LPCAT4	Q643R3	524 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	NRM	Q8IXM6	262 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	CBR4	Q8N4T8	237 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	WBP1	Q96G27	269 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	LDAH	Q9H6V9	325 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MYO15B-216	ENST00000580262	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262		H3BML4	177 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PDLIM1	O00151	329 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	LYPD3	O95274	346 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	NTN1	O95631	604 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PDGFA	P04085	211 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	THY1	P04216	161 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	HIST1H2AB	P04908	130 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	CHM	P24386	653 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	IGFBP5	P24593	272 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	IDUA	P35475	653 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	HSPA13	P48723	471 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PRKCD	Q05655	676 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SYT14P1	Q58G82	188 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SLC6A19	Q695T7	634 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SGTB	Q96EQ0	304 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	RDH12	Q96NR8	316 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	FEV	Q99581	238 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	USE1	Q9NZ43	259 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	ENO4	A6NNW6	628 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	HCN1	O60741	890 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	ACTL6A	O96019	429 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	MT-ATP6	P00846	226 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PEPD	P12955	493 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	FPR3	P25089	353 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SLC9A3	P48764	834 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	CTBP2	P56545	445 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	RAC1	P63000	192 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	COX10	Q12887	443 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	SEC23B	Q15437	767 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MYO15B-216	ENST00000580262	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		10.32	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106 ms