RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 COQ3Q9NZJ6 369 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED12LQ86YW9 2145 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGM6O95932 706 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAC3P60763 192 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOA3BQ3SY89 546 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPPEQ6ZT21 453 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 FKBP9P1Q75LS8 142 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 P4HA3Q7Z4N8 544 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf106Q8NAJ2 232 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOA3Q8NG57 546 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC38A4Q969I6 547 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSMCE2Q96MF7 247 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC13Q9H3R2 512 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MVM7 634 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE5AO76074 875 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNGR4O95473 234 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCGR2AP12318 317 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIO1P49895 249 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYBPHQ13203 477 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFI44LQ53G44 452 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP3Q96NJ6 502 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTR3BQ9P1U1 418 aa29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT2B1O00204 365 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGAP20933 346 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH12P55289 794 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEF8Q6ZN54 512 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRGPRGQ86SM5 289 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRXN1Q9BYN0 137 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 POTEKPQ9BYX7 375 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF6Q9Y252 685 aa29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0G2JNJ9 132 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC13A5PLN9 417 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPB2A8KAH6 182 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RCBTB2O95199 551 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMS2P2O95744 297 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNW1P05000 195 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF224P0DH78 156 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPB2Q16082 182 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP4R4Q6NUP7 873 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 XKRXQ6PP77 449 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF217Q8TC41 542 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 STK35Q8TDR2 534 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLPTM1LQ96KA5 538 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRRG4Q9BZD6 226 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q9UFV3 132 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC4Q9Y296 219 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WUJ7 227 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHP2O43745 196 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2A2Q6IF42 318 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAXEQ8NCW5 288 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDCCAG3Q96C92 435 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF122Q9H9V4 155 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPB7O75200 414 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASB5Q8WWX0 329 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASB9Q96DX5 294 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNPH1O43598 174 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 AQP8O94778 261 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNB4P30926 498 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R41P59536 307 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf46Q6UWT4 87 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJA3Q96EY1 480 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKD3O94806 890 aa29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 THY1P04216 161 aa29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGR4Q05215 589 aa29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf140Q5VVS0 124 aa29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A7Q9UM01 511 aa29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5F1O95221 314 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 IDUAP35475 653 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTX3Q5HYI7 312 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCN8Q6JVE9 175 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHFR2Q86XF0 187 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM86B1Q8N7N1 296 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF128Q8TEB7 428 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC41A3Q96GZ6 507 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYURFQ96I23 114 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRRC1Q96M27 445 aa29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms