RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568883.5

PKM-222, Transcript of pyruvate kinase M1/2, human

TSL 5 BASIC

Gene PKM, Length 1,863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKM-222	ENST00000568883	CSTA	P01040	98 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	IGF2	P01344	180 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	UCHL1	P09936	223 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	CLU	P10909	449 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	DIO1	P49895	249 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	MMP15	P51511	669 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	NTRK2	Q16620	822 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	OR4K13	Q8NH42	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	MCUB	Q9NWR8	336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKM-222	ENST00000568883		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ZNF749	O43361	778 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ITGA10	O75578	1167 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GYPB	P06028	91 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	NGFR	P08138	427 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	PNMT	P11086	282 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	OR10A3	P58181	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	SHH	Q15465	462 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	MED28	Q9H204	178 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	CD93	Q9NPY3	652 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	CTDSPL	O15194	276 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	OR7A10	O76100	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	IGKV1D-16	P01601	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	EPX	P11678	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ST6GAL1	P15907	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GABRG2	P18507	467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	EDNRA	P25101	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	STOM	P27105	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GALNS	P34059	522 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	RAG2	P55895	527 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	FHL1	Q13642	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	FAM53B	Q14153	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	PELI1	Q96FA3	418 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	CLEC1B	Q9P126	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	ING4	Q9UNL4	249 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKM-222	ENST00000568883	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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