RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564766.1

FUS-208, Transcript of FUS RNA binding protein, human

TSL 2

Gene FUS, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUS-208	ENST00000564766	CNTN1	Q12860	1018 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	GPR176	Q14439	515 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ZNF234	Q14588	700 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	KIR2DS5	Q14953	304 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	SHH	Q15465	462 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	DCAF10	Q5QP82	559 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	MLIP	Q5VWP3	458 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	PNCK	Q6P2M8	343 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	KCNMB4	Q86W47	210 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CACUL1	Q86Y37	369 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ZNF843	Q8N446	348 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	C17orf50	Q8WW18	174 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	NELFB	Q8WX92	580 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	GBF1	Q92538	1859 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TANK	Q92844	425 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	RAB1C	Q92928	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CPB2	Q96IY4	423 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	COPS8	Q99627	209 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	LYRM4	Q9HD34	91 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	STARD5	Q9NSY2	213 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	GPR83	Q9NYM4	423 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	NPTN	Q9Y639	398 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CEP290	O15078	2479 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ANK1	P16157	1881 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	LRP5L	A4QPB2	252 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766		A8MU76	341 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ANHX	E9PGG2	379 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	RS1	O15537	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ZNHIT1	O43257	154 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	SH3BGRL	O75368	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	RFPL2	O75678	378 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	SCGN	O76038	276 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	LINC00271	P0C7V0	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CXCL8	P10145	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	KCNE1	P15382	129 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CA4	P22748	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	MMP11	P24347	488 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CTNNA2	P26232	953 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	EPHA2	P29317	976 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CASP1	P29466	404 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ACOT2	P49753	483 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	CDH11	P55287	796 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	MYL6	P60660	151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	OSTN	P61366	133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	SLC20A2	Q08357	652 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	C1orf61	Q13536	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ITIH4	Q14624	930 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	GPNMB	Q14956	572 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	C3AR1	Q16581	482 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	AANAT	Q16613	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ACCSL	Q4AC99	568 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FUS-208	ENST00000564766	SFT2D3	Q587I9	215 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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