RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A1	P53985	500 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	NR1H2	P55055	460 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	FADD	Q13158	208 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	RAMP1	O60894	148 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	IMPDH2	P12268	514 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNA2	P20248	432 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	NTF4	P34130	210 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TAB1	Q15750	504 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	STON2	Q8WXE9	905 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	MAL2	Q969L2	176 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGT	Q969N2	578 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDL1	Q96EA4	605 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	USF3	Q68DE3	2245 aa		19.27	■□□□□ 0.68
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCRB	P14927	111 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	COX5A	P20674	150 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	FPR1	P21462	350 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	IL32	P24001	234 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP4B	P51164	291 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC103	Q8IW40	242 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf111	Q8N326	155 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B8	Q92506	261 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	DDIT4L	Q96D03	193 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEB18	Q96M61	343 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	EMC3	Q9P0I2	261 aa		19.26	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	PLAU	P00749	431 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	PRG2	P13727	222 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGX	Q8TBF5	258 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZAN	Q9Y493	2812 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCE1	Q9P212	2302 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM247	A6NEH6	219 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	NR5A2	O00482	541 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	SASH3	O75995	380 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-2	P23083	117 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	RIPPLY3	P57055	190 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2B6	P58173	313 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35A1	P78382	337 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL19	Q99731	98 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	VAPA	Q9P0L0	249 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT52	Q9Y366	437 aa		19.25	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR171	O14626	319 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	LYZL6	O75951	148 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	PGM3	O95394	542 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	SQLE	Q14534	574 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	AGK	Q53H12	422 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA11	Q86U17	422 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PP18	115 aa		19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	FOSL1	P15407	271 aa		19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	SHE	Q5VZ18	495 aa		19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	19.23	■□□□□ 0.67
PPP4C-205	ENST00000563200	CADM2	Q8N3J6	435 aa		19.23	■□□□□ 0.67

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