RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYNGR4O95473 234 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLDN14O95500 239 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF682O95780 498 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SERPINA1P01009 418 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFNA14P01570 189 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 THY1P04216 161 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 IMPDH2P12268 514 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTSSP25774 331 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL8A1P27658 744 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 HTR1EP28566 365 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCALDP61601 193 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SELENOWP63302 87 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASB5Q8WWX0 329 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM162AQ96A26 154 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF122Q9H9V4 155 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM27Q9HBJ8 222 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 BAG5Q9UL15 447 aa15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A0B4J2E0 115 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1B0GX12 115 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSD17B1P14061 328 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDH12P55289 794 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAC3P60763 192 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CBLL1Q75N03 491 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABHD3Q8WU67 409 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDIT4LQ96D03 193 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 TIGARQ9NQ88 270 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 NDE1Q9NXR1 346 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPDZO75970 2070 aa15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPN13Q12923 2485 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1W2PNV4 684 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF814B7Z6K7 855 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 C19orf84I3L1E1 186 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNFSF13O75888 250 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2B6P58173 313 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIRPAP78324 504 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 EGR4Q05215 589 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ELOA3BQ3SY89 546 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 VWA1Q6PCB0 445 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ULK3Q6PHR2 472 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 DEF8Q6ZN54 512 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FCRLAQ7L513 359 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ELOA3Q8NG57 546 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CACNA1CQ13936 2221 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 HECTD1Q9ULT8 2610 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 A8MVM7 634 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FMO6PO60774 539 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPIPB7O75200 414 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDE5AO76074 875 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 LYPD3O95274 346 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FPR1P21462 350 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FUT4P22083 530 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC103Q8IW40 242 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC38A4Q969I6 547 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADPRHL2Q9NX46 363 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRSS44E7EML9 344 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 DVL2O14641 736 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAMP1O60894 148 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PMS2P2O95744 297 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 GUSBP1Q15486 140 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR7A5Q15622 319 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms