RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	DUPD1	Q68J44	220 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CEP97	Q8IW35	865 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	GPATCH11	Q8N954	259 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CFAP36	Q96G28	342 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SNF8	Q96H20	258 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	MAGED4	Q96JG8	741 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	LPAR4	Q99677	370 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	PELI2	Q9HAT8	420 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	HAO1	Q9UJM8	370 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A1B0GTH9	108 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	MAGEB16	A2A368	324 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557		G3V3Y1	287 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	NDC80	O14777	642 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKRD28	O15084	1053 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TAPBP	O15533	448 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	HS6ST1	O60243	411 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CRLF1	O75462	422 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	MYO1D	O94832	1006 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	OR6B1	O95007	311 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	C1QA	P02745	245 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	COX6B1	P14854	86 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ABO	P16442	354 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF24	P17028	368 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	EPOR	P19235	508 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	HRH2	P25021	359 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CPOX	P36551	454 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	RGS4	P49798	205 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	AP1S2	P56377	157 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CLDN20	P56880	219 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TAS2R39	P59534	338 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	FGFBP1	Q14512	234 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	PPP1R7	Q15435	360 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	OR4D1	Q15615	310 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	XKR6	Q5GH73	641 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	RNF175	Q8N4F7	328 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC5A8	Q8N695	610 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	NRGN	Q92686	78 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SLCO2A1	Q92959	643 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	NCLN	Q969V3	563 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ESAM	Q96AP7	390 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM68	Q96MH6	324 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	UCK2	Q9BZX2	261 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	RHBG	Q9H310	441 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MRPS11-208	ENST00000559557	SNX12	Q9UMY4	172 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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