RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 H3BN98 237 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 K7ENP7 123 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ZIC3O60481 467 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 PEPDP12955 493 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 OSMP13725 252 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 HK1P19367 917 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CHMP24386 653 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 FPR3P25089 353 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CTBP2P56545 445 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 LTBQ06643 244 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CDK20Q8IZL9 346 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 OR51A7Q8NH64 312 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 MED12Q93074 2177 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TAAR8Q969N4 342 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 RDH12Q96NR8 316 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 MUS81Q96NY9 551 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 FAM173AQ9BQD7 235 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 RNF32Q9H0A6 362 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 C12orf10Q9HB07 376 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 DKKL1Q9UK85 242 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 H3BML4 177 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 K7EM74 188 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 NME2P1O60361 137 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CD46P15529 392 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ACADSP16219 412 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 NME2P22392 152 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 HTR3AP46098 478 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 MEOX1P50221 254 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TNFSF10P50591 281 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CRISP1P54107 249 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 COX10Q12887 443 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 MED21Q13503 144 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 GXYLT1Q4G148 440 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ZNF766Q5HY98 468 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 BROXQ5VW32 411 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 PARP8Q8N3A8 854 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 UBE2FQ969M7 185 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 SGTBQ96EQ0 304 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ARL5BQ96KC2 179 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 MRGPRX4Q96LA9 322 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 C5orf34Q96MH7 638 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 AASSQ9UDR5 926 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.23□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 UNC119BA6NIH7 251 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 FAM166BA8MTA8 275 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 A8MVM7 634 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 BCKDKO14874 412 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TRAPPC6AO75865 159 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 PDGFAP04085 211 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 GSTM3P21266 225 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 GDF1P27539 372 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 DLX5P56178 289 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 FXYD6P3P58550 94 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 RAET1LQ5VY80 246 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TTC23Q5W5X9 447 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 SCMH1Q96GD3 660 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.22□□□□□ -0.93
SRP54-208ENST00000555557 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms