RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 BEND4Q6ZU67 534 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PTOV1Q86YD1 416 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CADM2Q8N3J6 435 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CGREF1Q99674 301 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TMEM38AQ9H6F2 299 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF232Q9UNY5 417 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa18.52■□□□□ 0.56
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CS-222ENST00000550996 C5orf58C9J3I9 102 aa18.52■□□□□ 0.56
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CS-222ENST00000550996 TPST1O60507 370 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
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CS-222ENST00000550996 MTPNP58546 118 aa18.52■□□□□ 0.56
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CS-222ENST00000550996 SCARB2Q14108 478 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TSC22D1Q15714 1073 aa18.52■□□□□ 0.56
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CS-222ENST00000550996 REEP3Q6NUK4 255 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 STK32CQ86UX6 486 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
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CS-222ENST00000550996 C3orf49Q96BT1 292 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CCDC134Q9H6E4 229 aa18.52■□□□□ 0.56
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CS-222ENST00000550996 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 UQCRBP14927 111 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 OR3A2P47893 321 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 ZSWIM7Q19AV6 140 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 DDIT4LQ96D03 193 aa18.51■□□□□ 0.55
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CS-222ENST00000550996 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 ACTR6Q9GZN1 396 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 PRSS50Q9UI38 385 aa18.51■□□□□ 0.55
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CS-222ENST00000550996 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 EVPLLA8MZ36 301 aa18.5■□□□□ 0.55
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CS-222ENST00000550996 HTR2AP28223 471 aa18.5■□□□□ 0.55
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CS-222ENST00000550996 LIPT2A6NK58 231 aa18.49■□□□□ 0.55
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CS-222ENST00000550996 FPR1P21462 350 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 CXCR1P25024 350 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 MAP2K6P52564 334 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 SLC16A1P53985 500 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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CS-222ENST00000550996 KLF10Q13118 480 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 GALNT5Q7Z7M9 940 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 NINJ1Q92982 152 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 SLC35B4Q969S0 331 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 S100PBPQ96BU1 408 aa18.49■□□□□ 0.55
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CS-222ENST00000550996 ART1P52961 327 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 SLC35A1P78382 337 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 DMTNQ08495 405 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 SFRP5Q5T4F7 317 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-222ENST00000550996 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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