RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ACER2	Q5QJU3	275 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LIN9	Q5TKA1	542 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF130	Q86XS8	419 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TRPV1	Q8NER1	839 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2T33	Q8NG76	320 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF596	Q8TC21	504 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM110B	Q8TC76	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MITD1	Q8WV92	249 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NRGN	Q92686	78 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PANX2	Q96RD6	677 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GAL3ST1	Q99999	423 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NT5DC2	Q9H857	520 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PXMP2	Q9NR77	195 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GRIN2D	O15399	1336 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ITSN1	Q15811	1721 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RTL1	A6NKG5	1358 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGEF10	O15013	1369 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FLT4	P35916	1363 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM94	Q12767	1356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DCC	P43146	1447 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SMCO2	A6NFE2	343 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GABRR3	A8MPY1	467 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		K7ERQ8	282 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CETN3	O15182	167 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CLOCK	O15516	846 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PSTPIP1	O43586	416 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NMT2	O60551	498 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3BGRL	O75368	114 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	STAMBP	O95630	424 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		P04436	131 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FCGR3A	P08637	254 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GSTM3	P21266	225 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKACB	P22694	351 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87	2e-6	■■■□□ 15.5
FAM49B-222	ENST00000522702	RRM2	P31350	389 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	UQCRFS1	P47985	274 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	POU3F4	P49335	361 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HLCS	P50747	726 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CRYBA2	P53672	197 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPA2	P54652	639 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DAOA	P59103	153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	STK38	Q15208	465 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CD226	Q15762	336 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT71	Q3SY84	523 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	WSCD1	Q658N2	575 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC31	Q6UY01	552 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TPRA1	Q86W33	373 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HPS6	Q86YV9	775 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL16	Q8N461	479 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR7G2	Q8NG99	324 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KIFAP3	Q92845	792 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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