RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ARMCX5Q6P1M9 558 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM64Q6YI46 380 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ERICH1Q86X53 443 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 GPR148Q8TDV2 347 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ERGIC2Q96RQ1 377 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ATP6V0BQ99437 205 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 KRT23Q9C075 422 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CARD9Q9H257 536 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 STARD5Q9NSY2 213 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 IL37Q9NZH6 218 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CD300AQ9UGN4 299 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 STK38LQ9Y2H1 464 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ETV7Q9Y603 341 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ATP8B3O60423 1300 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 NFASCO94856 1347 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ARL5CA6NH57 179 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 GOLGA8RI6L899 631 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 BUB1O43683 1085 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 PEX11AO75192 247 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SMIM24O75264 130 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CCNE2O96020 404 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 GLAP06280 429 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CALM1P0DP23 149 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CALM2P0DP24 149 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CALM3P0DP25 149 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CLUP10909 449 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 GALP22466 123 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 KCNJ1P48048 391 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CLDN6P56747 220 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 TSPAN5P62079 268 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLC34A1Q06495 639 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLC3A1Q07837 685 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 PLD1Q13393 1074 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 RIPK1Q13546 671 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 RUNX3Q13761 415 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 AANATQ16613 207 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 UTF1Q5T230 341 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CENPPQ6IPU0 288 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 RFWD3Q6PCD5 774 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 IYDQ6PHW0 289 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 DEFB119Q8N690 84 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 MRAPQ8TCY5 172 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLC5A11Q8WWX8 675 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 PTP4A1Q93096 173 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 RFT1Q96AA3 541 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 NTNG2Q96CW9 530 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC39Q96DD0 335 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 NTMT1Q9BV86 223 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CARD6Q9BX69 1037 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLITRK2Q9H156 845 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF302Q9NR11 478 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SENP1Q9P0U3 644 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SNX6Q9UNH7 406 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 AURKCQ9UQB9 309 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-220ENST00000512069 ASB3Q9Y575 518 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms