RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 YES1P07947 543 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 UQCRBP14927 111 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ETS2P15036 469 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR3AP46098 478 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PCYT1AP49585 367 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 REEP3Q6NUK4 255 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC103Q8IW40 242 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRG1Q8N1C3 465 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC43A2Q8N370 569 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf82Q8WW14 230 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 C3orf49Q96BT1 292 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SAR1AQ9NR31 198 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 F8P00451 2351 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DSCAMO60469 2012 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ENO4A6NNW6 628 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF208O43345 1280 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 OPN1SWP03999 348 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYGSP22914 178 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 LOXP28300 417 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2B6P58173 313 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DMTNQ08495 405 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF10Q13118 480 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TESK1Q15569 626 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 REP15Q6BDI9 236 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DDIT4LQ96D03 193 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR14Q9BWN1 585 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTR6Q9GZN1 396 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GP6Q9HCN6 339 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT52Q9Y366 437 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 MED13LQ71F56 2210 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 EVPLLA8MZ36 301 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAR1BP31321 381 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 NTF4P34130 210 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 OR3A2P47893 321 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 IST1P53990 364 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP51A1Q16850 503 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 BEND4Q6ZU67 534 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 STK32CQ86UX6 486 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX32Q86XE0 403 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 S100PBPQ96BU1 408 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3IP1Q96FE7 263 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMCX1Q9P291 453 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 HIVEP1P15822 2718 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF724A8MTY0 619 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-9P01782 118 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PTNP21246 168 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 FPR1P21462 350 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A2P23975 617 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 H3F3AP84243 136 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7A5Q15622 319 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 RABL3Q5HYI8 236 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SMYD1Q8NB12 490 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 HIPK4Q8NE63 616 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPEARQ8WU66 669 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PIF1Q9H611 641 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 USP22Q9UPT9 525 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGPT4Q9Y264 503 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 LIPT2A6NK58 231 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 MRASO14807 208 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 AKR7A3O95154 331 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAP00813 363 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCR1P25024 350 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 IDUAP35475 653 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 GZMMP51124 257 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 COPZ1P61923 177 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 EGR4Q05215 589 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms