RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509563.1

CANX-215, Transcript of calnexin, human

TSL 4

Gene CANX, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CANX-215	ENST00000509563	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	VAT1	Q99536	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	LPAR4	Q99677	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	NPAS2	Q99743	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	NUP205	Q92621	2012 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SH2D1B	O14796	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	LRRTM2	O43300	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	B4GAT1	O43505	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	OR1F1	O43749	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	CST8	O60676	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	APOC2	P02655	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	NGFR	P08138	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ANXA8	P13928	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	DAO	P14920	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	GLRA1	P23415	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	DUSP5	Q16690	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	EXO5	Q9H790	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	TPST2	O60704	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	IGSF6	O95976	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CANX-215	ENST00000509563	HPR	P00739	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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