RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 RLIMQ9NVW2 624 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 NPAP1Q9NZP6 1156 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM181Q9P2C4 612 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CHST2Q9Y4C5 530 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CDHR4A6H8M9 788 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF208O43345 1280 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 LY6G6DO95868 133 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 HEXAP06865 529 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TFPTP0C1Z6 253 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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HOXB3-211ENST00000490677 TACR3P29371 465 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 SLC1A3P43003 542 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC9AQ6UXN8 241 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa24.54■■□□□ 1.52
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HOXB3-211ENST00000490677 EMC3Q9P0I2 261 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV3-9P01782 118 aa24.53■■□□□ 1.52
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HOXB3-211ENST00000490677 SOD3P08294 240 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 IL7RP16871 459 aa24.53■■□□□ 1.52
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HOXB3-211ENST00000490677 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.53■■□□□ 1.52
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC38A5Q8WUX1 472 aa24.53■■□□□ 1.52
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HOXB3-211ENST00000490677 TPT1P8Q9HAU6 139 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 NGBQ9NPG2 151 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 LAMP3Q9UQV4 416 aa24.53■■□□□ 1.52
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HOXB3-211ENST00000490677 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 EPGNQ6UW88 154 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 BDH2Q9BUT1 245 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CXorf56Q9H5V9 222 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 MALT1Q9UDY8 824 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 OR5H1A6NKK0 313 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 PDLIM1O00151 329 aa24.51■■□□□ 1.51
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HOXB3-211ENST00000490677 OR52P1PQ8NH57 321 aa24.51■■□□□ 1.51
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HOXB3-211ENST00000490677 SHISA9B4DS77 424 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 ERLIN1O75477 346 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 BCHEP06276 602 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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HOXB3-211ENST00000490677 GNA13Q14344 377 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 SLC17A1Q14916 467 aa24.49■■□□□ 1.51
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HOXB3-211ENST00000490677 CLIP4Q8N3C7 705 aa24.49■■□□□ 1.51
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HOXB3-211ENST00000490677 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 FAM234BA2RU67 622 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 RAD51DO75771 328 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 CD8AP01732 235 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 NUDT7P0C024 238 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB3-211ENST00000490677 BMP2P12643 396 aa24.48■■□□□ 1.51
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