RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 PMM1Q92871 262 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 SLA2Q9H6Q3 261 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CNIH4Q9P003 139 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FRG2CA6NGY1 282 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 REM1O75628 298 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 YES1P07947 543 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CSF3P09919 207 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PRKCAP17252 672 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 IFNA8P32881 189 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 GRHL3Q8TE85 626 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ART5Q96L15 291 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PLD2O14939 933 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FGFBP1Q14512 234 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 XKRXQ6PP77 449 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 APOOLQ6UXV4 268 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 RDH10Q8IZV5 341 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 BEX2Q9BXY8 128 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FABP12A6NFH5 140 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 NOTOA8MTQ0 251 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 B4DXG7 233 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ALX3O95076 343 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 OR5F1O95221 314 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ONECUT2O95948 504 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CSTAP01040 98 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 IL1AP01583 271 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 MYL9P24844 172 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 COX10Q12887 443 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 NRMQ8IXM6 262 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PRSS27Q9BQR3 290 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 A0A0B4J293 547 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 SERINC4A6NH21 518 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 TMCC2O75069 709 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 UTS2O95399 124 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 RAB36O95755 333 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 IL33O95760 270 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CCKBRP32239 447 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CD226Q15762 336 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 Q5BKY6 102 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 C17orf51A8MQB3 221 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PRR33A8MZF0 331 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 GMFGO60234 142 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 HPGDP15428 266 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 GPR4P46093 362 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CD83Q01151 205 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 GALK2Q01415 458 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 C22orf42Q6IC83 251 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CADM2Q8N3J6 435 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 PCNX2A6NKB5 2137 aa15.83■□□□□ 0.13
PRRT4-205ENST00000489835 FAM25AB3EWG3 89 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms