RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MAL2	Q969L2	176 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZG16B	Q96DA0	208 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NPAS1	Q99742	590 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LIME1	Q9H400	295 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	BCO1	Q9HAY6	547 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ACER3	Q9NUN7	267 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ITPR3	Q14573	2671 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FAAH	O00519	579 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OIP5	O43482	229 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	DNPH1	O43598	174 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	YES1	P07947	543 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT7	P0C024	238 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FPR1	P21462	350 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	AGTR1	P30556	359 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CCKAR	P32238	428 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PGM1	P36871	562 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR3A	P46098	478 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PDK3	Q15120	406 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGT	Q969N2	578 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		15.41	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A1	P30825	629 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT2	P50583	147 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NR1H2	P55055	460 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	COPZ1	P61923	177 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RY6	Q15077	328 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FCRLA	Q7L513	359 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF550	Q7Z398	422 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TREML1	Q86YW5	311 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NDE1	Q9NXR1	346 aa		15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF724	A8MTY0	619 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA14	P01570	189 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CD99	P14209	185 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CD53	P19397	219 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SFTPD	P35247	375 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SESN3	P58005	492 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MXRA7	P84157	204 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	BEX5	Q5H9J7	111 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF220	Q5VTB9	566 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		15.39	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CDHR4	A6H8M9	788 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP73	A6NFT4	308 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CYTIP	O60759	359 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ENPP1	P22413	925 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAR1B	P31321	381 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RYK	P34925	604 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SELPLG	Q14242	412 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK11	Q15759	364 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ADRM1	Q16186	407 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RABL3	Q5HYI8	236 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SHE	Q5VZ18	495 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GRINA	Q7Z429	371 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	VRK2	Q86Y07	508 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35B4	Q969S0	331 aa		15.38	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PIF1	Q9H611	641 aa		15.38	■□□□□ 0.05

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