RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488601.6

POLR1C-208, Transcript of RNA polymerase I and III subunit C, human

TSL 2

Gene POLR1C, Length 973 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1C-208	ENST00000488601	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SKIL	P12757	684 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	IL1RN	P18510	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	UGT1A6	P19224	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MAOA	P21397	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PAX8	Q06710	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CDO1	Q16878	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	FRZB	Q92765	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RILP	Q96NA2	401 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	DOK1	Q99704	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PAGE4	O60829	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RDH16	O75452	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	FOXH1	O75593	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CLIC3	O95833	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR4A8	P0C604	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CYP11B1	P15538	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MSH3	P20585	1137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ACADL	P28330	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SDC4	P31431	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PSMB10	P40306	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NPY2R	P49146	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	LINC00205	P59089	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	BECN1	Q14457	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A0U1RQV1	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CBY3	A6NI87	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601		M0R1B8	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RP2	O75695	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ACP2	P11117	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	KRT3	P12035	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ASPH	Q12797	758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	EPS8	Q12929	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CRYM	Q14894	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	HFE	Q30201	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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