RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	AKAP9	Q99996	3911 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	GPR171	O14626	319 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SIAH2	O43255	324 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ADA	P00813	363 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ARAF	P10398	606 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	BMP2	P12643	396 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	NR1H2	P55055	460 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SCARB2	Q14108	478 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	P2RY6	Q15077	328 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	STK11	Q15831	433 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404		Q6ZT83	130 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	DSCAM	O60469	2012 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PGM3	O95394	542 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	GPI	P06744	558 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	THBD	P07204	575 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ETS2	P15036	469 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	FPR1	P21462	350 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC6A2	P23975	617 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PRKAR1B	P31321	381 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	CDK6	Q00534	326 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	NFYC	Q13952	458 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PDK3	Q15120	406 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	MBD6	Q96DN6	1003 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	CCL19	Q99731	98 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	NGB	Q9NPG2	151 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PRSS50	Q9UI38	385 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ITPR3	Q14573	2671 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	HIVEP1	P15822	2718 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404		A0A1W2PPR1	153 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404		A8MVM7	634 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	FRS3	O43559	492 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	LYZL6	O75951	148 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	AHSA1	O95433	338 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	PRG2	P13727	222 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	AQP1	P29972	269 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC16A1	P53985	500 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	OR7A5	Q15622	319 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CHMP3-208	ENST00000486404	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.42	□□□□□ -0.58

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