RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475726.5

MYH9-208, Transcript of myosin heavy chain 9, human

TSL 3

Gene MYH9, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYH9-208	ENST00000475726	FCMR	O60667	390 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SPAG7	O75391	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	UGT2B17	O75795	530 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	FGF4	P08620	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	IL2RG	P31785	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SERPINB5	P36952	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PTGR1	Q14914	329 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MAGEA8	P43361	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	H3F3A	P84243	136 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MECR	Q9BV79	373 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CHRNG	P07510	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SOAT1	P35610	550 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PGM1	P36871	562 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SERPINF1	P36955	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	OR2B6	P58173	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PRPS1	P60891	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PLAUR	Q03405	335 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MAPK14	Q16539	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CA10	Q9NS85	328 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	KLF11	O14901	512 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	STX11	O75558	287 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	STAMBP	O95630	424 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	WNT11	O96014	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	AK1	P00568	194 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	IMPDH2	P12268	514 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MPG	P29372	298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	RYK	P34925	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	HBA1	P69905	142 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	COQ8B	Q96D53	544 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726		B9A039	149 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CFLAR	O15519	480 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	LILRA1	O75019	489 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PEX11A	O75192	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PDE5A	O76074	875 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	VENTX	O95231	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	TACSTD2	P09758	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CCNA2	P20248	432 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MATN1	P21941	496 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	GIF	P27352	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	PPOX	P50336	477 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	CHN2	P52757	468 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MYH9-208	ENST00000475726	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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