RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MED4Q9NPJ6 270 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RASSF1Q9NS23 344 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMCX1Q9P291 453 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS50Q9UI38 385 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RTTNQ86VV8 2226 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3D21A4FU49 640 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP73A6NFT4 308 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NNC1 897 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF716A6NP11 495 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 M0QX08 132 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SULT2B1O00204 365 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB7O75200 414 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LYPD3O95274 346 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OPN1SWP03999 348 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 THY1P04216 161 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TFPIP10646 304 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 POU2F1P14859 743 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ETS2P15036 469 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PTNP21246 168 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FUT4P22083 530 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ME2P23368 584 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT2B10P36537 528 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CD79BP40259 229 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC1A3P43003 542 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CPA2P48052 419 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2B6P58173 313 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 H3F3AP84243 136 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SORDQ00796 357 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 EGR4Q05215 589 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LTBQ06643 244 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NFYCQ13952 458 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 POU4F3Q15319 338 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NPTX1Q15818 432 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LIN52Q52LA3 116 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 REEP3Q6NUK4 255 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX32Q86XE0 403 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC20BQ86Y33 519 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 P3H2Q8IVL5 708 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SMYD1Q8NB12 490 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 BBS10Q8TAM1 723 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPEARQ8WU66 669 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PMM1Q92871 262 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC58Q96CX6 371 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 BCO1Q9HAY6 547 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 HHATLQ9HCP6 504 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CALML5Q9NZT1 146 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 STOML1Q9UBI4 398 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PROCRQ9UNN8 238 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT52Q9Y366 437 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ARID1AO14497 2285 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 EVPLLA8MZ36 301 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R3H8 397 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 MRASO14807 208 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGPT2O15123 496 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF4O43474 513 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX14O75381 377 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKD3O94806 890 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PMS2P2O95744 297 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 PLAUP00749 431 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms