RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449491.1

USP25-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 5

Gene USP25, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-205ENST00000449491 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 OR51B6Q9H340 312 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SP140LQ9H930 580 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CD209Q9NNX6 404 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 IFNKQ9P0W0 207 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 EMCNQ9ULC0 261 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 KPTNQ9Y664 436 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PTPRUQ92729 1446 aa3.36□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 EPM2AB3EWF7 344 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 H0YJX3 145 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SMLR1H3BR10 107 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FBP2O00757 339 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SYT7O43581 403 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PI15O43692 258 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SNX3O60493 162 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GRAP2O75791 330 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CST4P01036 141 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ANXA5P08758 320 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC35E2P0CK97 266 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 HSMCR30P0CW71 290 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CTRB1P17538 263 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TEAD1P28347 426 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GJB2P29033 226 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 UGT1A5P35504 534 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TGM4P49221 684 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CEBPGP53567 150 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CDC20Q12834 499 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GK3PQ14409 553 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NECTIN1Q15223 517 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SPHARQ15513 63 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC1A5Q15758 541 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FUT10Q6P4F1 479 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 UQCC3Q6UW78 93 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ZNF786Q8N393 782 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FAM3CQ92520 227 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 C10orf35Q96D05 121 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CEP19Q96LK0 163 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 C9orf72Q96LT7 481 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 COPS8Q99627 209 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LPAR4Q99677 370 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CIB1Q99828 191 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 HSD17B14Q9BPX1 270 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MED10Q9BTT4 135 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 DPH7Q9BTV6 452 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CACNG2Q9Y698 323 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms