RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CADM2	Q8N3J6	435 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PNR3	127 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	NME4	O00746	187 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	FZD7	O75084	574 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	PRKD3	O94806	890 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	FES	P07332	822 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	TFPI	P10646	304 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ENPP1	P22413	925 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	KDELR2	P33947	212 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	CRYBA2	P53672	197 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	CTBP2	P56545	445 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35A1	P78382	337 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	FOXF2	Q12947	444 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	MYBPH	Q13203	477 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	KIF18B	Q86Y91	864 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	PROX1	Q92786	737 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	STARD4	Q96DR4	205 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	UCK2	Q9BZX2	261 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	PIF1	Q9H611	641 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0B4J2E0	115 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GWA3	101 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GX12	115 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	FRS3	O43559	492 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	CYTIP	O60759	359 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPB7	O75200	414 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	OPN1SW	P03999	348 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	GPI	P06744	558 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	HSD17B1	P14061	328 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	HTR2A	P28223	471 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	GSK3B	P49841	420 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SORD	Q00796	357 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WUJ7	227 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241		A8MXE2	369 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	CXCR6	O00574	342 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	GSTA4	O15217	222 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T1	O43869	369 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	CGA	P01215	116 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	YES1	P07947	543 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	COX6B1	P14854	86 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	CALB2	P22676	271 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	AGTR1	P30556	359 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	IDUA	P35475	653 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SLC16A1	P53985	500 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	SELENOW	P63302	87 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PTPA-222	ENST00000445241	H3F3A	P84243	136 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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