RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHODO00212 210 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPEO14579 308 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ICOSLGO75144 302 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPAG7O75391 227 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT6AP02538 564 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT6BP04259 564 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHRNGP07510 517 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHRM4P08173 479 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTA1P08263 222 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35E2P0CK97 266 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PORP16435 677 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL12BP29460 328 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHRNB4P30926 498 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NTSP30990 170 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD17B3P37058 310 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT6CP48668 564 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAGLUP54802 743 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP10-9P60411 292 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 VSNL1P62760 191 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLE4Q04727 773 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPB3Q12988 150 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYBPHQ13203 477 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ART3Q13508 389 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCLAFQ15004 111 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NTRK2Q16620 822 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIPR1Q53HC9 387 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGGQ5H8A4 983 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP157Q5JU67 520 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf185Q5T7R7 199 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 WLSQ5T9L3 541 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGSNQ5TDP6 509 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5M10Q6IEU7 315 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A7Q6PXP3 512 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM107Q6UX40 140 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPSR1Q6W5P4 371 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAGAPQ8N103 731 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF615Q8N8J6 731 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8K3Q8NH51 312 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL6Q8TCB7 284 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB40AQ8WXH6 277 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMPDL3BQ92485 455 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRGNQ92686 78 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMBIM1Q969X1 311 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 EME1Q96AY2 570 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 L3HYPDHQ96EM0 354 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKNOX2Q96KN3 472 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 LURAP1Q96LR2 239 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM111AQ96PZ2 611 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NODALQ96S42 347 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS22Q9GZN4 317 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXorf56Q9H5V9 222 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 AAMDCQ9H7C9 122 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRF2Q9HAW0 419 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH2D2AQ9NP31 389 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 AHSPQ9NZD4 102 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLRT3Q9NZU0 649 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS29Q9UBQ0 182 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACAD8Q9UKU7 415 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACANP16112 2415 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARID1AO14497 2285 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0G2JK05 382 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAGE10A6NGK3 116 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TP53I11O14683 189 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLIN3O60664 434 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT2B11O75310 529 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAP00813 363 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHG3P01860 377 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP1B1P05026 303 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms