RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC5A2P31639 672 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 NKAIN2Q5VXU1 208 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4M2Q8NGB6 313 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6C1Q96RD1 312 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFAF4Q9P032 175 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GWA3 101 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL15A6NJ78 407 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 GOSR2O14653 212 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 GPRIN2O60269 458 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A5O76082 557 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 EPHA4P54764 986 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 MED25Q71SY5 747 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC16A11Q8NCK7 471 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 CHPT1Q8WUD6 406 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 ULBP2Q9BZM5 246 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GTW7 788 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A2P29034 98 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 GARNL3Q5VVW2 1013 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 LRIT2A6NDA9 550 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP33O14559 1287 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 CD27P26842 260 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 AQP2P41181 271 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC1A3P43003 542 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GLCTQ6Y288 498 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB11FIP2Q7L804 512 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SIMC1Q8NDZ2 872 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 NUDT8Q8WV74 236 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC46A1Q96NT5 459 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
PTPRJ-201ENST00000418331 MSX1P28360 303 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 NR4A2P43354 598 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TPRA1Q86W33 373 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ITPKCQ96DU7 683 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ENKD1Q9H0I2 346 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ABRACLQ9P1F3 81 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FXYD4P59646 89 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PYCR3Q53H96 274 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MANEAQ5SRI9 462 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PQ09 198 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 WDPCPO95876 746 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 AKAIN1P0CW23 69 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8G3PP0DMU2 310 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR2AP28223 471 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM64Q6YI46 380 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF281Q9Y2X9 895 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MMACHCQ9Y4U1 282 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SPOCK1Q08629 439 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM69AQ5T7M9 428 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2UQ5VVX9 321 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MTFR2Q6P444 385 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OLIG3Q7RTU3 272 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PARP16Q8N5Y8 322 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 UTS2O95399 124 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ENTHD1Q8IYW4 607 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MEIS3P1A6NDR6 274 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC16A6O15403 523 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAF2O60831 178 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PTHP01270 115 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ICAM2P13598 275 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC6A12P48065 614 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TGFBR3Q03167 851 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 GAB1Q13480 694 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM53Q6P2H8 277 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0A6YYH2 397 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 A6NJ64 397 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 GABRA5P31644 462 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 MISPQ8IVT2 679 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ALG12Q9BV10 488 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 H0Y8X5 98 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK2P24941 298 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 GDF7Q7Z4P5 450 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4N4Q8N0Y3 316 aa19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms