RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 IL1F10Q8WWZ1 152 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 UCN3Q969E3 161 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NCLNQ969V3 563 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAJC19Q96DA6 116 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CMTM7Q96FZ5 175 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TIMD4Q96H15 378 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CEP170P1Q96L14 293 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 C12orf66Q96MD2 445 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 KCNA7Q96RP8 456 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TESK2Q96S53 571 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RIT2Q99578 217 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MCHR1Q99705 422 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ARHGDIGQ99819 225 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC6A7Q99884 636 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPXQ9BT56 116 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 DUSP16Q9BY84 665 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ROGDIQ9GZN7 287 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 COMMD4Q9H0A8 199 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATG10Q9H0Y0 220 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 C1orf21Q9H246 121 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PPDPFQ9H3Y8 114 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RBKSQ9H477 322 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MEAF6Q9HAF1 191 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SIAEQ9HAT2 523 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELOVL3Q9HB03 270 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLGRKTQ9HBL7 147 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 LPAR2Q9HBW0 351 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZFP14Q9HCL3 533 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MMP26Q9NRE1 261 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMOD2Q9NZR1 351 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 GNG12Q9UBI6 72 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEC14L3Q9UDX4 400 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 BTNL2Q9UIR0 455 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 GNPTGQ9UJJ9 305 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF229Q9UJW7 825 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF225Q9UK10 706 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MMP17Q9ULZ9 603 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 AURKCQ9UQB9 309 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SMC3Q9UQE7 1217 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHMP2BQ9UQN3 213 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRAPPC4Q9Y296 219 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 KNSTRNQ9Y448 316 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 WDR45Q9Y484 360 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 OARD1Q9Y530 152 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 GMPPBQ9Y5P6 360 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDH10Q9Y6N8 788 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 V9GY05 133 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC7Q96M83 1385 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 KAT6BQ8WYB5 2073 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CLSPNQ9HAW4 1339 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A087WZY1 265 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A0G2JRQ6 117 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A1B0GUL7 405 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 GSAPA4D1B5 854 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 LRP5LA4QPB2 252 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 METTL21EPA6NDL7 271 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 HELTA6NFD8 242 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCNX2A6NKB5 2137 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PP2D1A8MPX8 630 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 A8MUI8 341 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRDCB7Z8K6 153 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 E7ESA3 106 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 E9PMD0 336 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 GFYI3L273 518 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SGK494L7N484 410 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAPK13O15264 365 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHADO15335 359 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MSH4O15457 936 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZSCAN12O43309 604 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 RIPK2O43353 540 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 MED7O43513 233 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRPSAP2O60256 369 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 UGT1A9O60656 530 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 TOM1O60784 492 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-177P-201ENST00000411257 SMPD2O60906 423 aa0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms