RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 TCTE1Q5JU00 501 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 ZAR1Q86SH2 424 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 PARGQ86W56 976 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 PLCZ1Q86YW0 608 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 ZNF527Q8NB42 609 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 HMGB4Q8WW32 186 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 TRIM63Q969Q1 353 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 GON7Q9BXV9 100 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.97□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 SMIM30A4D0T7 59 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 H0YIG0 161 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 NCR1O76036 304 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 UBL3O95164 117 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 CSTAP01040 98 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 IL9P15248 144 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 FUT1P19526 365 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 RAG2P55895 527 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 SIRPAP78324 504 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 CDK5R1Q15078 307 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 FRMD1Q8N878 549 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 ZNF614Q8N883 585 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 RCBTB1Q8NDN9 531 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 PATE1Q8WXA2 126 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 RNF170Q96K19 258 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 TBX5Q99593 518 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 WACQ9BTA9 647 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 HDHD2Q9H0R4 259 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 C12orf10Q9HB07 376 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 NRIP3Q9NQ35 241 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 MOKQ9UQ07 419 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 RASD1Q9Y272 281 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-203ENST00000402697 A0A0G2JK05 382 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ZNF879B4DU55 563 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 PDCD5O14737 125 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CTDSPLO15194 276 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 OR7A10O76100 309 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TPPPO94811 219 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 DHFRP00374 187 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 C1QBP02746 253 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CSF2P04141 144 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 UCHL1P09936 223 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 AHCYP23526 432 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 PYCR1P32322 319 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 MMP15P51511 669 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SLC25A1P53007 311 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 OR12D2P58182 307 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SLC3A1Q07837 685 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SLC6A19Q695T7 634 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GHSRQ92847 366 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ART5Q96L15 291 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 MNTQ99583 582 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 FAM60AQ9NP50 221 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PPC4 97 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 FLRT2O43155 660 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ARHGEF9O43307 516 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 FOXS1O43638 330 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SCO2O43819 266 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 IGKV1D-16P01601 117 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 NGFRP08138 427 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 MAB21L1Q13394 359 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TNK1Q13470 666 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 KLHL26Q53HC5 615 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 EMC4Q5J8M3 183 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 KIRREL2Q6UWL6 708 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms