RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ULK3Q6PHR2 472 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PLXDC2Q6UX71 529 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 FITM2Q8N6M3 262 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOA3Q8NG57 546 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf49Q96BT1 292 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGDIGQ99819 225 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 UCK2Q9BZX2 261 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 COQ10BQ9H8M1 238 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 GP6Q9HCN6 339 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM72A0PK05 275 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKD3O94806 890 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 FESP07332 822 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CD247P20963 164 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PEX19P40855 299 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 GSK3BP49841 420 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ASCL1P50553 236 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35A1P78382 337 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXF2Q12947 444 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 MYBPHQ13203 477 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CDSNQ15517 529 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 NRF1Q16656 503 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATS1Q496A3 300 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf46Q6UWT4 87 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 FCRLAQ7L513 359 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM214BQ7L5A3 538 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 STK35Q8TDR2 534 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ROBO4Q8WZ75 1007 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 MCHR1Q99705 422 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SRXN1Q9BYN0 137 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL9Q9P2J3 617 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GWA3 101 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 M0R3H8 397 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CXCR6O00574 342 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 IDUAP35475 653 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2B6P58173 313 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1Q1Q15612 314 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF613Q6PF04 617 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF217Q8TC41 542 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF128Q8TEB7 428 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL5BQ96KC2 179 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11A1Q9GZK7 315 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCFQ9NPI8 374 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 USP22Q9UPT9 525 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 B2RBV5 119 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 MSTNO14793 375 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFSF13O75888 250 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 AHSA1O95433 338 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 GPIP06744 558 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 COX6B1P14854 86 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CALB2P22676 271 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 HTR2AP28223 471 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNA8P32881 189 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYBA2P53672 197 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SELENOWP63302 87 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SIRPAP78324 504 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM201Q5SNT2 666 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 COMTD1Q86VU5 262 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF18BQ86Y91 864 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6T1Q8NGN1 323 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGXQ8TBF5 258 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PROCRQ9UNN8 238 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNA1DQ01668 2161 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms