RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ARMC6Q6NXE6 501 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SYCE2Q6PIF2 218 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PGAP1Q75T13 922 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TPRA1Q86W33 373 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KLBQ86Z14 1044 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM126BQ8IUX1 230 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD6LQ8IWD5 586 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ALLCQ8N6M5 410 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM99Q8N816 258 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 POC1AQ8NBT0 407 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ITFG1Q8TB96 612 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC107Q8WV48 283 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CACNG8Q8WXS5 425 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MRGPRFQ96AM1 343 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TESCQ96BS2 214 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LINGO1Q96FE5 620 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FOXC2Q99958 501 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DPY30Q9C005 99 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MED28Q9H204 178 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GOLPH3Q9H4A6 298 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM231Q9H6L2 316 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LYRM4Q9HD34 91 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CD209Q9NNX6 404 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DYRK4Q9NR20 520 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PLSCR3Q9NRY6 295 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SEMA4GQ9NTN9 838 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OAZ3Q9UMX2 235 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 WDR83OSQ9Y284 106 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FRMPD4Q14CM0 1322 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EMSYQ7Z589 1322 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYO10Q9HD67 2058 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM186AA6NE01 2351 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JLW4 131 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SCO1O75880 301 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPANK1O95872 356 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LDLRP01130 860 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OXTP01178 125 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ALPLP05186 524 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CSN2P05814 226 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ANXA5P08758 320 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CCNB1P14635 433 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF43P17038 809 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TAC1P20366 129 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2H1P32780 548 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CD80P33681 288 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UGT1A3P35503 534 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PRELPP51888 382 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SEC61GP60059 68 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYL6P60660 151 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VSNL1P62760 191 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CSNK1G2P78368 415 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ENPEPQ07075 957 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SMCO1Q147U7 214 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDSNQ15517 529 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TXNRD1Q16881 649 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC12BQ2HXU8 276 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PAQR7Q86WK9 346 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPSM1Q86YR5 675 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CROCCP3Q8IVE0 287 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KBTBD2Q8IY47 623 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FNDC5Q8NAU1 212 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPX8Q8TED1 209 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 COQ8BQ96D53 544 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF570Q96NI8 536 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OMDQ99983 421 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HINT2Q9BX68 163 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SMPD4Q9NXE4 827 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ING4Q9UNL4 249 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 STK36Q9NRP7 1315 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CNTNAP1P78357 1384 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LOC105371242A0A075B767 164 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0J9YVX5 310 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms