RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF165Q6ZSG1 346 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2L13Q8N349 312 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 FTMTQ8N4E7 242 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01555Q8NAE3 123 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF540Q8NDQ6 660 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAIP1Q8WWC4 291 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 UCN3Q969E3 161 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC22AQ96IW7 307 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H4GQ99525 98 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF670Q9BS34 389 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRN3Q9H3W5 708 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 VCPKMTQ9H867 229 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A22Q9H936 323 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 AIG1Q9NVV5 245 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASF1AQ9Y294 204 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEMO1Q9Y316 297 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 V9GY05 133 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3TC1Q8TE82 1336 aa1.84□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMB11A5LHX3 300 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PINLYPA6NC86 204 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP27XA6NNY8 438 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MUA0 341 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 IDSB3KWA1 339 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCTN6O00399 190 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED7O43513 233 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT1A9O60656 530 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIRAS1O95057 198 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGI1O95970 557 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 P04436 131 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 DBTP11182 482 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF44P15621 663 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CALCRP30988 508 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RDXP35241 583 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPHP41219 470 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGDSP41222 190 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASP4P49662 377 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFNB2P52799 333 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP107P57740 925 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP12-2P59991 146 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASPHQ12797 758 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDK3Q15120 406 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC152Q4G0S7 254 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAGE3Q5JUK9 113 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf71Q6IPW1 123 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRP9Q7RTR0 991 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC65Q8IXS2 484 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RDH10Q8IZV5 341 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCAF4L2Q8NA75 395 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 C20orf203Q8NBC4 194 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CATSPER1Q8NEC5 780 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 IPMKQ8NFU5 416 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR51S1Q8NGJ8 323 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2T3Q8NH03 318 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRSK1Q8TDC3 778 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM151AQ8WW52 585 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGCQ92535 297 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB34Q9BZG1 259 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELENOIQ9C0D9 397 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBKSQ9H477 322 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOLH1BQ9HBA9 442 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF25Q9UIL4 384 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAP1Q9ULZ2 295 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMCO1Q9UM00 188 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDRP35968 1356 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NIZ1 184 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MXQ7 604 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPLX1O14810 134 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBTPS2O43462 519 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPB7O75200 414 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTX2O75431 263 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5LO75964 103 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAMBPO95630 424 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 INSP01308 110 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT6AP02538 564 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR2C1P13056 603 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 POU2F1P14859 743 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF17P17021 662 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFC4P35249 363 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R19P59542 299 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPS1P60891 318 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAP1BP61224 184 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS14P62263 151 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms