RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358064.3

HIST4H4-201, Transcript of histone cluster 4 H4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HIST4H4, Length 1,918 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST4H4-201ENST00000358064 C6orf136Q5SQH8 315 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SUSD1Q6UWL2 747 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 RNF165Q6ZSG1 346 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 B3GNT7Q8NFL0 401 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 OR2T35Q8NGX2 323 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 OR56B4Q8NH76 319 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ITCHQ96J02 903 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PIGMQ9H3S5 423 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ALG9Q9H6U8 611 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 RNF122Q9H9V4 155 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 FBXL2Q9UKC9 423 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 NCOR2Q9Y618 2525 aa10□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PLSCR5A0PG75 271 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TM4SF5O14894 197 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PRAMEF2O60811 474 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 RGS11O94810 467 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SERPINA3P01011 423 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ZNF883P0CG24 379 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 IDSP22304 550 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 CTSSP25774 331 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SSTR2P30874 369 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 S100A11P31949 105 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ACTR1BP42025 376 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ACTR1AP61163 376 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ERVK-25P63136 954 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 METRNLQ641Q3 311 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 VASNQ6EMK4 673 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ISCA2Q86U28 154 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PXT1Q8NFP0 134 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 CXorf58Q96LI9 332 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 LURAP1Q96LR2 239 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 HS6ST2Q96MM7 605 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PFDN5Q99471 154 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ASIC5Q9NY37 505 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 VNN3Q9NY84 501 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ACSL6Q9UKU0 697 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 LRP4O75096 1905 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TTLL8A6PVC2 850 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 GADD45GO95257 159 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 MPC1LP0DKB6 136 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 GALP22466 123 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 MSX1P28360 303 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 POU3F4P49335 361 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 NUDT6P53370 316 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ILKQ13418 452 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 C1orf61Q13536 156 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SHBQ15464 509 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 OR4D1Q15615 310 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 NTRK2Q16620 822 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 FAM122BQ7Z309 247 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 DEFB124Q8NES8 71 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 OR1S1Q8NH92 325 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 EXT2Q93063 718 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TEX37Q96LM6 180 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 LRRC61Q9BV99 259 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.99□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 C5orf52A6NGY3 159 aa9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 DISC1C4P0D8 188 aa9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 FLRT2O43155 660 aa9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 SSNA1O43805 119 aa9.98□□□□□ -0.81
HIST4H4-201ENST00000358064 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms