RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 UNCXA6NJT0 531 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 F13BP05160 661 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CA3P07451 260 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TNFSF8P32971 234 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TATDN3Q17R31 274 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 BCL7AQ4VC05 210 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CASD1Q96PB1 797 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HHIPQ96QV1 700 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC22A23A1A5C7 686 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 RAB33AQ14088 237 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GALEQ14376 348 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CMIPQ8IY22 773 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MITD1Q8WV92 249 aa15.01□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 APEHP13798 732 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PVRP15151 417 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ARSAP15289 507 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TGM4P49221 684 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 THBS3P49746 956 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PCBD1P61457 104 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 RUNX2Q13950 521 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ERV3-1Q14264 604 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SHEQ5VZ18 495 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GTF2H4Q92759 462 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 UHRF2Q96PU4 802 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 IL37Q9NZH6 218 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 A0A0B4J2A0 478 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 J3KTA2 159 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CACNG3O60359 315 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PPT1P50897 306 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 BTN1A1Q13410 526 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 C18orf63Q68DL7 685 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OR56B4Q8NH76 319 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF75AQ96N20 296 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SHPKQ9UHJ6 478 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC22A7Q9Y694 548 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 OR7A17O14581 309 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ITGAMP11215 1152 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R46P59540 309 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC35F3Q8IY50 421 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SVBPQ8N300 66 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GPR150Q8NGU9 434 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HRASLSQ9HDD0 168 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GPR160Q9UJ42 338 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GABRPO00591 440 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 F3P13726 295 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TFAP2CQ92754 450 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ABOP16442 354 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SERPINF1P36955 418 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HTR5AP47898 357 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 HSD17B7P56937 341 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ8Q15842 424 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ALKAL2Q6UX46 152 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 INPP5EQ9NRR6 644 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SRPK3Q9UPE1 567 aa15□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 FCGR2AP12318 317 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 IL32P24001 234 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SNCAP37840 140 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 TLE1Q04724 770 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 GGHQ92820 318 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 PLA2G7Q13093 441 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 STEAP3Q658P3 488 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 LACC1Q8IV20 430 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 METTL15A6NJ78 407 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 RNF212BA8MTL3 300 aa14.99□□□□□ -0.01
RXRA-201ENST00000356384 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms