RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336057.9

HDAC5-202, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC5, Length 5,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-202ENST00000336057 A0A1B0GWA3 101 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ACOD1A6NK06 481 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SLC43A1O75387 559 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TEAD1P28347 426 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 IRS1P35568 1242 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 LTBQ06643 244 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ELP2Q6IA86 826 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PSD2Q9BQI7 771 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 H3BNC9 293 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 UBL3O95164 117 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ETHE1O95571 254 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DPTQ07507 201 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MPIG6BO95866 241 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GNRHRP30968 328 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 NUDT1P36639 197 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 USP51Q70EK9 711 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GPX5O75715 221 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TNFRSF4P43489 277 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SQSTM1Q13501 440 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 AQP6Q13520 282 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 NKG7Q16617 165 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 YIPF6Q96EC8 236 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ALG12Q9BV10 488 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF264O43296 627 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 EPHA2P29317 976 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SSTR2P30874 369 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 POU4F3Q15319 338 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ARL14Q8N4G2 192 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CDC6Q99741 560 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CHST8Q9H2A9 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PEX14O75381 377 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CRYZL1O95825 349 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RAB3AP20336 220 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ACY1Q03154 408 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR7A5Q15622 319 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 APMAPQ9HDC9 416 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 A0A087WUU8 490 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MYO7AQ13402 2215 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TMEM72A0PK05 275 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SERINC4A6NH21 518 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TMPRSS11DO60235 418 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SYNGR4O95473 234 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TMEM225BP0DP42 221 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TGFBR1P36897 503 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GDNFP39905 211 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ETV5P41161 510 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ETV1P50549 477 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 HTRA3P83110 453 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MOKQ9UQ07 419 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PIP5K1CO60331 668 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 HTR3AP46098 478 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 NMNAT3Q96T66 252 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PRRT1Q99946 306 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 FN3KQ9H479 309 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 LDAHQ9H6V9 325 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 HBQ1P09105 142 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PTPN6P29350 595 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms