RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDIT4LQ96D03 193 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED18Q9BUE0 208 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAR1AQ9NR31 198 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDM4Q9UKN5 801 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF716A6NP11 495 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF724A8MTY0 619 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIAH2O43255 324 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMPDH2P12268 514 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP2K6P52564 334 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPZ1P61923 177 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXC5Q00444 222 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD34AQ69YU3 496 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT73Q86Y46 540 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRG1Q8N1C3 465 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIPK4Q8NE63 616 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf49Q96BT1 292 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIME1Q9H400 295 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM181Q9P2C4 612 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL14Q9P2G3 628 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAPPC4Q9Y296 219 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR14LQ5THK1 2151 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPR1 153 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB108AA8MXU0 73 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAMP1O60894 148 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYGSP22914 178 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A2P23975 617 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDNRAP25101 427 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP1P29972 269 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2B6P58173 313 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF10Q13118 480 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDK3Q15120 406 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP51A1Q16850 503 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXW10Q5XX13 1052 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf82Q8WW14 230 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANCFQ9NPI8 374 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGBPQ9NV56 204 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM229AB2RXF0 380 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXYD1O00168 92 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASKO14936 926 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPST1O60507 370 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 THBDP07204 575 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCR1P25024 350 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR3A2P47893 321 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3F3AP84243 136 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBBP4Q09028 425 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 BNIP2Q12982 314 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf65Q8NCR3 313 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGXQ8TBF5 258 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF226Q9NYT6 803 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS50Q9UI38 385 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP3CBP16298 524 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR2AP28223 471 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDUAP35475 653 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A1P53985 500 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35A1P78382 337 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 COQ5Q5HYK3 327 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 REP15Q6BDI9 236 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT5Q7Z7M9 940 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX32Q86XE0 403 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC103Q8IW40 242 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF607Q96SK3 696 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 POTEKPQ9BYX7 375 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTR6Q9GZN1 396 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMC3Q9P0I2 261 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR52Q9Y2T5 361 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPT2A6NK58 231 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBIP1A8MTZ0 92 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MVM7 634 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB7O75200 414 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFN2O95140 757 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 FPR1P21462 350 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 GZMMP51124 257 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMTNQ08495 405 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPRE2Q15555 327 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 TESK1Q15569 626 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 NANOGP8Q6NSW7 305 aa17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms