RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281821.6

EPHA4-201, Transcript of EPH receptor A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHA4, Length 6,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4-201ENST00000281821 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CHST11Q9NPF2 352 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CD300AQ9UGN4 299 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 DLGAP3O95886 979 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ACP2P11117 423 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 KLRB1Q12918 225 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CEBPEQ15744 281 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 USP22Q9UPT9 525 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 LRRC42Q9Y546 428 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 WDR1O75083 606 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF20P17024 532 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 GABARAPL2P60520 117 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 TUBA4AP68366 448 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SYT14P1Q58G82 188 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 GFRALQ6UXV0 394 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CCDC103Q8IW40 242 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OR51A7Q8NH64 312 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF566Q969W8 418 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ABCD3P28288 659 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SLC37A1P57057 533 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 PUDPQ08623 228 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 TUBA3CQ13748 450 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 NKD1Q969G9 470 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OXGR1Q96P68 337 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 MND1Q9BWT6 205 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 LHX6Q9UPM6 363 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 MYO10Q9HD67 2058 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 PRODHO43272 600 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CBX7O95931 251 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 MYF5P13349 255 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 S100GP29377 79 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 IL12AP29459 219 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OPRM1P35372 400 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 RHAGQ02094 409 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF385BQ569K4 471 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 FBXO27Q8NI29 283 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 FEVQ99581 238 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SNPHO15079 494 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SCGNO76038 276 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 IGF2P01344 180 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 H2BFMP0C1H6 154 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 NPR2P20594 1047 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 APLNRP35414 380 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OR7A5Q15622 319 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CCNJQ5T5M9 372 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 RNF175Q8N4F7 328 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 HAS2Q92819 552 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 LANCL2Q9NS86 450 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 PTPRDP23468 1912 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 FAM149AA5PLN7 773 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OR14I1A6ND48 311 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CENPXA8MT69 81 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 PTGES3LE9PB15 166 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 MED26O95402 600 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 HTR1AP08908 422 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 HSMCR30P0CW71 290 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SFTPDP35247 375 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SOX3P41225 446 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ARTNQ5T4W7 220 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OR52D1Q9H346 318 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 OPA3Q9H6K4 179 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHA4-201ENST00000281821 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms