RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.53■□□□□ 0.88
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UFD1-201ENST00000263202 CHRNA9Q9UGM1 479 aa20.53■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.53■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 A8MVM7 634 aa20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 EFNA2O43921 213 aa20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 OR7A10O76100 309 aa20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 CH25HO95992 272 aa20.52■□□□□ 0.88
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UFD1-201ENST00000263202 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 FXYD6P3P58550 94 aa20.52■□□□□ 0.88
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UFD1-201ENST00000263202 SULF2Q8IWU5 870 aa20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 STK35Q8TDR2 534 aa20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 TAAR8Q969N4 342 aa20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 KLHL1Q9NR64 748 aa20.52■□□□□ 0.88
UFD1-201ENST00000263202 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.52■□□□□ 0.88
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UFD1-201ENST00000263202 PTP4A3O75365 173 aa20.51■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 NME2P22392 152 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ADH6P28332 368 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ISL1P61371 349 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 FHL1Q13642 323 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ZNF74Q16587 644 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 OAFQ86UD1 273 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SETD9Q8NE22 299 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 APOL4Q9BPW4 351 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ZFP64Q9NPA5 681 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 DKKL1Q9UK85 242 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 FREM3P0C091 2139 aa20.51■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.5■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 CDK5Q00535 292 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 LTBQ06643 244 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 FANK1Q8TC84 345 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 LIPHQ8WWY8 451 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 OSTF1Q92882 214 aa20.5■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 ZNF208O43345 1280 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 CD46P15529 392 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SRD5A2P31213 254 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SLC9A3P48764 834 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 MAP2K6P52564 334 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 GINS1Q14691 196 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ZBED5Q49AG3 693 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 C1orf140Q5VVS0 124 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 C12orf73Q69YU5 71 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 C5orf46Q6UWT4 87 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 OR51A7Q8NH64 312 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.5■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.5■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 HCN1O60741 890 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 BGLAPP02818 100 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TNFSF10P50591 281 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 NUP107P57740 925 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 IL5RAQ01344 420 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TLE3Q04726 772 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 CD47Q08722 323 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 BROXQ5VW32 411 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 UBE2FQ969M7 185 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SCMH1Q96GD3 660 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 C5orf34Q96MH7 638 aa20.49■□□□□ 0.87
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