RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.3□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR51B6Q9H340 312 aa11.3□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.3□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM183AA6NL82 134 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AQP2P41181 271 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GPR85P60893 370 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BTG2P78543 158 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FUNDC1Q8IVP5 155 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC35F3Q8IY50 421 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SGCZQ96LD1 299 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ENY2Q9NPA8 101 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ASB1Q9Y576 335 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KIAA0513O60268 411 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 STK17BO94768 372 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLAG1Q6DJT9 500 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HHLA2Q9UM44 414 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KLK10O43240 276 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DIRAS3O95661 229 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CXCR4P61073 352 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CAMK2DQ13557 499 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IL10RAQ13651 578 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AWAT2Q6E213 333 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LAIR1Q6GTX8 287 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CHIAQ9BZP6 476 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MOSPD3O75425 235 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TSPAN12O95859 305 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IL11RAQ14626 422 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MAVSQ7Z434 540 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PELI3Q8N2H9 469 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TAMM41Q96BW9 452 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANKRD60Q9BZ19 345 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C2orf72A6NCS6 295 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RAD1O60671 282 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ITGB2P05107 769 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GTF2F2P13984 249 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AMY2BP19961 511 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HOXD12P35452 270 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FXYD6P3P58550 94 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM69AQ5T7M9 428 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM163Q8TC26 289 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR10A4Q9H209 315 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HTR3BO95264 441 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NID1P14543 1247 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BSGP35613 385 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HTR5AP47898 357 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 P2RX1P51575 399 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ART1P52961 327 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR6T1Q8NGN1 323 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NPR2P20594 1047 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR5W2Q8NH69 310 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SDF2Q99470 211 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PPT2Q9UMR5 302 aa11.28□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TNFSF14O43557 240 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GAB1Q13480 694 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC36A2Q495M3 483 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 XKRXQ6PP77 449 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.27□□□□□ -0.6
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SARAFQ96BY9 339 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms