RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ASCL1P50553 236 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 MAP2K6P52564 334 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PSME3P61289 254 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PPP4R4Q6NUP7 873 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FCRLAQ7L513 359 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FAM214BQ7L5A3 538 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 AP3M1Q9Y2T2 418 aa19.89■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GWA3 101 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ELOVL7A1L3X0 281 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF814B7Z6K7 855 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 M0R3H8 397 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SULT2B1O00204 365 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FESP07332 822 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CXCR1P25024 350 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 KDELR2P33947 212 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SIRPAP78324 504 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 H3F3AP84243 136 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 EGR4Q05215 589 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 C6orf89Q6UWU4 347 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 OR6T1Q8NGN1 323 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 POTEKPQ9BYX7 375 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PIGMQ9H3S5 423 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TMEM181Q9P2C4 612 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TAGLN3Q9UI15 199 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PACSIN3Q9UKS6 424 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC4Q9Y296 219 aa19.88■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1DQ01668 2161 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CYTIPO60759 359 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GSK3BP49841 420 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 OR1Q1Q15612 314 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 OR52E4Q8NGH9 312 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 DDIT4LQ96D03 193 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF559Q9BR84 538 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TRIM2Q9C040 744 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 EVA1AQ9H8M9 152 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GLRX2Q9NS18 164 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FREM1Q5H8C1 2179 aa19.87■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ITPR2Q14571 2701 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RAMP1O60894 148 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PRKD3O94806 890 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 THY1P04216 161 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CD8BP10966 210 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 KRT72Q14CN4 511 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 LUZP2Q86TE4 346 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TUSC5Q8IXB3 177 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CCDC197Q8NCU1 140 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PSD2Q9BQI7 771 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 C12orf10Q9HB07 376 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 KLHL28Q9NXS3 571 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FBN2P35556 2912 aa19.86■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 A0A0B4J2E0 115 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GX12 115 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 A8MVM7 634 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 MSTNO14793 375 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FMO6PO60774 539 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 LYPD3O95274 346 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PRF1P14222 555 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 AGTR1P30556 359 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC43A2Q8N370 569 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF610Q8N9Z0 462 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 OR6K3Q8NGY3 331 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A4Q969I6 547 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ALG2Q9H553 416 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 BCO1Q9HAY6 547 aa19.85■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 LIPT2A6NK58 231 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 DNPH1O43598 174 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FPR1P21462 350 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 OR2B6P58173 313 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A3Q00325 362 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CYBRD1Q53TN4 286 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ULK3Q6PHR2 472 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CCDC103Q8IW40 242 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 STK35Q8TDR2 534 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A7Q8TE54 656 aa19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms