RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 KCTD7Q96MP8 289 aa16.61■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.61■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 KLHL26Q53HC5 615 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 VWA2Q5GFL6 755 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 C1orf189Q5VU69 101 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 PRR22Q8IZ63 422 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 OR52N1Q8NH53 320 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 JAM3Q9BX67 310 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 DVL2O14641 736 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 IL1AP01583 271 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 GALNSP34059 522 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ZMAT1Q5H9K5 638 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 APOOLQ6UXV4 268 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 CMIPQ8IY22 773 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 POC5Q8NA72 575 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 OR5M3Q8NGP4 307 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 HTRA1Q92743 480 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 NAT6Q93015 286 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 TEAD3Q99594 435 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 KLHDC3Q9BQ90 382 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 NEURL2Q9BR09 285 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ALG8Q9BVK2 526 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa16.6■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 EFCAB7A8K855 629 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SLC2A5P22732 501 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 FOXL2P58012 376 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 PSPHP78330 225 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 CBLN3Q6UW01 205 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 RTL4Q6ZR62 310 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SCAIQ8N9R8 606 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 C3orf49Q96BT1 292 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ZNF524Q96C55 264 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 KATNB1Q9BVA0 655 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.59■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 A0A087WUJ7 227 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 MCIDASD6RGH6 385 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SLC6A6P31641 620 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 RUNX1T1Q06455 604 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 FNDC7Q5VTL7 733 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 D2HGDHQ8N465 521 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SDR9C7Q8NEX9 313 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SLC2A12Q8TD20 617 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SGTBQ96EQ0 304 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 SIAEQ9HAT2 523 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 MMACHCQ9Y4U1 282 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 V9GYH0 126 aa16.58■□□□□ 0.25
USP18-201ENST00000215794 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SHISA3A0PJX4 238 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CDC14CA4D256 554 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CD8B2A6NJW9 211 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 DDAH2O95865 285 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CD8BP10966 210 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 PEPDP12955 493 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SPNP16150 400 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 PNLIPP16233 465 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF3P17036 446 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 HK1P19367 917 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CCR4P51679 360 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 CD300CQ08708 224 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ACSM1Q08AH1 577 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF721Q8TF20 911 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 OR1F2PQ96R84 312 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 WDR70Q9NW82 654 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa16.57■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 DAPL1A0PJW8 107 aa16.57■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 ISPDA4D126 451 aa16.57■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.57■□□□□ 0.24
USP18-201ENST00000215794 C17orf51A8MQB3 221 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms