RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637266.2

SCN2A-215, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,610 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-215ENST00000637266 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 MAKP20794 623 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TUBG1P23258 451 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ACVR1BP36896 505 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CAV2P51636 162 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 SLC36A2Q495M3 483 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 BCL7AQ4VC05 210 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 VNN3Q9NY84 501 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 GABARAPH6UMI1 98 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 COCHO43405 550 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 PIP5K1CO60331 668 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF91Q05481 1191 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 WDR76Q9H967 626 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CBLCQ9ULV8 474 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 PSAT1Q9Y617 370 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 MROH6A6NGR9 719 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 RAB5AP20339 215 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 GDI1P31150 447 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CNR2P34972 360 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CCR9P51686 369 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 KIAA1024LP59773 190 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TPBGQ13641 420 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TATDN3Q17R31 274 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 BOD1Q96IK1 185 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 SORT1Q99523 831 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 LRRC30A6NM36 301 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 AIPO00170 330 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TAS2R45P59539 299 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 RAC1P63000 192 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 EVX2Q03828 476 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 METTL4Q8N3J2 472 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ABCG8Q9H221 673 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CRLF2Q9HC73 371 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 C1QBP02746 253 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 REEP5Q00765 189 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 DHODHQ02127 395 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 C6orf183Q5T699 404 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 KCTD11Q693B1 232 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 LGI3Q8N145 548 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CCDC120Q96HB5 630 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 A0A087WZY1 265 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TNFRSF10CO14798 259 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ARPC5O15511 151 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 JMJD7P0C870 316 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 HLA-DOBP13765 273 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 LNX2Q8N448 690 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ASB11Q8WXH4 323 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 C7orf34Q96L11 122 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 IER2Q9BTL4 223 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 IQCF5A8MTL0 148 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 GPR75O95800 540 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 HTR2CP28335 458 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-215ENST00000637266 S100A11P31949 105 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms