RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635806.1

SPTAN1-227, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 193 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-227ENST00000635806 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 K7ERQ8 282 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SOCS6O14544 535 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 ARPC3O15145 178 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 XRCC3O43542 346 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GREM1O60565 184 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CTNSO60931 367 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TOXO94900 526 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 PAPLNO95428 1278 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 HPXP02790 462 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 PRNPP04156 253 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 LPLP06858 475 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GP1BAP07359 652 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 PET100P0DJ07 73 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CTSAP10619 480 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TFPIP10646 304 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 NID1P14543 1247 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SPI1P17947 270 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SLC2A5P22732 501 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 MPZP25189 248 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TEAD1P28347 426 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 PYCR1P32322 319 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CSF2RBP32927 897 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GPR4P46093 362 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SLC11A1P49279 550 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 MEOX2P50222 304 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 HCCSP53701 268 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TAS2R31P59538 309 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TAS2R19P59542 299 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TAS2R20P59543 309 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SSTP61278 116 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CXADRP78310 365 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SIRPAP78324 504 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CAP1Q01518 475 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SLC3A1Q07837 685 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 FZD5Q13467 585 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 RAB33AQ14088 237 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 MEF2DQ14814 521 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GPNMBQ14956 572 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 COL19A1Q14993 1142 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 FAM189A2Q15884 450 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 LINC00303Q3SY05 128 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 AMZ1Q400G9 498 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 RNF212Q495C1 297 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 Q499Y3 187 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 RTP2Q5QGT7 225 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 AVPI1Q5T686 147 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 DRAM2Q6UX65 266 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 APOOLQ6UXV4 268 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 RTL10Q7L3V2 364 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 SZRD1Q7Z422 152 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 RNF180Q86T96 592 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 AMZ2Q86W34 360 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 NRROSQ86YC3 692 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 NRMQ8IXM6 262 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 CMTM4Q8IZR5 234 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 COMMD1Q8N668 190 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 TMEM99Q8N816 258 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 NUP43Q8NFH3 380 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 OR5D16Q8NGK9 328 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 OR5M8Q8NGP6 311 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 OR10K1Q8NGX5 313 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-227ENST00000635806 OR6S1Q8NH40 331 aa4.09□□□□□ -1.75
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