RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-215	ENST00000612980	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CADM3	Q8N126	398 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SDF2	Q99470	211 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	HYKK	A2RU49	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980		H0YGG7	62 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980		H3BN98	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980		J3QRE1	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980		M0R129	80 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CTDSP2	O14595	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PRODH	O43272	600 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	B3GALT2	O43825	422 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	FMO6P	O60774	539 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PTP4A3	O75365	173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	UGT2B17	O75795	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	RAB36	O95755	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GPR75	O95800	540 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TNF	P01375	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	IL1A	P01583	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	STATH	P02808	62 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ATP1B1	P05026	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	HMGN1	P05114	100 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	THBS1	P07996	1170 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	NR2F6	P10588	404 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CPM	P14384	443 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	UGT2B7	P16662	529 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ALOX12	P18054	663 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	S1PR1	P21453	382 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	DRD5	P21918	477 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	DNASE1	P24855	282 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	FPR3	P25089	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	IFNA8	P32881	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	S100A5	P33763	92 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MC3R	P41968	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ETV1	P50549	477 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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