RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-210ENST00000580357 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SNX32Q86XE0 403 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 STARD4Q96DR4 205 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 DOCK7Q96N67 2140 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CACNA1CQ13936 2221 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SULT2B1O00204 365 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 AP3D1O14617 1153 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 DNPH1O43598 174 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SNX3O60493 162 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PMS2P2O95744 297 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 C8BP07358 591 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 GKN3PP0CG01 181 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 DRD4P21917 467 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ENPP1P22413 925 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SHC1P29353 583 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TACR3P29371 465 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CPA2P48052 419 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 MTPNP58546 118 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 GNGT1P63211 74 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 GUSBP1Q15486 140 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 REP15Q6BDI9 236 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 FCRLAQ7L513 359 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 OR10A6Q8NH74 314 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PROCRQ9UNN8 238 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 HCFC1P51610 2035 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 A0A1W2PNR3 127 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ADAM11O75078 769 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 COX4I1P13073 169 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 KIR2DL3P43628 341 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 DIO1P49895 249 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 LUZP2Q86TE4 346 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 STK32CQ86UX6 486 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PTOV1Q86YD1 416 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 C10orf111Q8N326 155 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 RNF128Q8TEB7 428 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ARMCX1Q9P291 453 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 MED12LQ86YW9 2145 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 M0QX08 132 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 NDUFAB1O14561 156 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 MFN2O95140 757 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CGAP01215 116 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 IFNA14P01570 189 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 YES1P07947 543 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PCGF2P35227 344 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 GZMMP51124 257 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SIRPAP78324 504 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 VEZF1Q14119 521 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SELPLGQ14242 412 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PDK3Q15120 406 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 VMACQ2NL98 169 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 VWA1Q6PCB0 445 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CADM2Q8N3J6 435 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 FAM222BQ8WU58 562 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ZNF559Q9BR84 538 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TRIM2Q9C040 744 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 FAM107BQ9H098 131 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 C12orf10Q9HB07 376 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.67□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms