RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PQ72 361 aa26.56■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR7A10O76100 309 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDT14O95848 222 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDK4P11802 303 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TACR3P29371 465 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 MLLT10P55197 1068 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 C17orf67Q0P5P2 114 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM164Q5U3C3 297 aa26.56■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa26.56■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ENKD1Q9H0I2 346 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 MCCC2Q9HCC0 563 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP25Q9NPA2 562 aa26.56■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AADACL4Q5VUY2 407 aa26.55■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5M3Q8NGP4 307 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 DUSP19Q8WTR2 217 aa26.55■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SPRY4Q9C004 299 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2J2O76002 312 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFB2O95178 105 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADORA3P0DMS8 318 aa26.54■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB40BQ12829 278 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 FHL1Q13642 323 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 LYPD8Q6UX82 237 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFAF7Q7L592 441 aa26.54■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 YIPF6Q96EC8 236 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A0C4DFX4 3053 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAM10O14672 748 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXO45P0C2W1 286 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCN2P20062 427 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXK2Q01167 660 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF367Q7RTV3 350 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR119Q8TDV5 335 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 PARD6AQ9NPB6 346 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 CMC2Q9NRP2 79 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 VGLL3A8MV65 326 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9orf172C9J069 976 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXCR1P25024 350 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDH11P55287 796 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 DHRS13Q6UX07 377 aa26.53■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PIP4P1Q86T03 277 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCFL5Q9UL49 500 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 PMS2P1A4D2B8 440 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM64BA6NI03 449 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 M0R3G1 203 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOCS6O14544 535 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC2A10O95528 541 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB36O95755 333 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTHP01270 115 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAX7P23759 505 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTNR1AP48039 350 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 NTRK2Q16620 822 aa26.52■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF524Q96C55 264 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNFT2Q96EX2 444 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASL10BQ96S79 203 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHDC3Q9BQ90 382 aa26.52■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R10Q9NYW0 307 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 OSGIN1Q9UJX0 560 aa26.52■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 QPRTQ15274 297 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF74Q16587 644 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL28A1Q2UY09 1125 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKDD1AQ495B1 522 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 HES3Q5TGS1 186 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52I1Q8NGK6 324 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM234Q8WY98 164 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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