RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	DDIT4L	Q96D03	193 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ARL5B	Q96KC2	179 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	C7orf26	Q96N11	449 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL19	Q99731	98 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	NGB	Q9NPG2	151 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS50	Q9UI38	385 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0G2JPF8	293 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM247	A6NEH6	219 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	FAAH	O00519	579 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF208	O43345	1280 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	DNPH1	O43598	174 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PLAU	P00749	431 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	BCHE	P06276	602 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TACR3	P29371	465 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC1A3	P43003	542 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IDH3A	P50213	366 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MVD	P53602	400 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CRISP3	P54108	245 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2B6	P58173	313 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	DSTN	P60981	165 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	STX1B	P61266	288 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PLAUR	Q03405	335 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	EPS8	Q12929	822 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TAB1	Q15750	504 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPK11	Q15759	364 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GTDC1	Q4AE62	458 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS33A	Q96AX1	596 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RLIM	Q9NVW2	624 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	EMC3	Q9P0I2	261 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP6	Q13023	2319 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCA4	P78363	2273 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM72	A0PK05	275 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CDHR4	A6H8M9	788 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF716	A6NP11	495 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CLIC1	O00299	241 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR171	O14626	319 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	LYZL6	O75951	148 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CD3E	P07766	207 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GKN3P	P0CG01	181 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCR1	P25024	350 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	COPZ1	P61923	177 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC35A1	P78382	337 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	H3F3A	P84243	136 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RGN	Q15493	299 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	LIN52	Q52LA3	116 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms