RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	LCA5L	O95447	670 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	AP2A1	O95782	977 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CST4	P01036	141 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NR3C1	P04150	777 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GLA	P06280	429 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS1	P07477	247 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ALOX5	P09917	674 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CT62	P0C5K7	136 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MYOG	P15173	224 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NQO2	P16083	231 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT1A4	P22310	534 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GNA11	P29992	359 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R1B	P30154	601 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXN2	P32314	431 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNA8	P32881	189 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	VHL	P40337	213 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ETV5	P41161	510 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K8	P41279	467 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR3A2	P47893	321 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CX3CR1	P49238	355 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC26A2	P50443	739 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UCN	P55089	124 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	BACE1	P56817	501 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MYL6	P60660	151 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTO1	P78417	241 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB40B	Q12829	278 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLAMF1	Q13291	335 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DMC1	Q14565	340 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CHI3L2	Q15782	390 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF10	Q5QP82	559 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52W1	Q6IF63	320 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HSDL2	Q6YN16	418 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZVQ6	151 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PID1	Q7Z2X4	250 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM110B	Q8TC76	370 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ART4	Q93070	314 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OMA1	Q96E52	524 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TSSK3	Q96PN8	268 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT11	Q9BT88	431 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MFF	Q9GZY8	342 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2AG1	Q9H205	316 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9HAA7	133 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PELI2	Q9HAT8	420 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NTN4	Q9HB63	628 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CD209	Q9NNX6	404 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NRN1	Q9NPD7	142 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF24	Q9Y225	148 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	USP16	Q9Y5T5	823 aa		2.38	□□□□□ -2.03

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