RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555068.1

AC004825.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004825.1, Length 586 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004825.1-201ENST00000555068 WDR34Q96EX3 536 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 RHOJQ9H4E5 214 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TIGARQ9NQ88 270 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CADP27708 2225 aa4.86□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 C1orf226A1L170 272 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 FRG2CA6NGY1 282 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PLPP1O14494 284 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TAPBPO15533 448 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 DNPH1O43598 174 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 HCRTR2O43614 444 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SCO2O43819 266 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 KIAA0513O60268 411 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 NUDT3O95989 172 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 KLK1P06870 262 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TUBBP07437 444 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SLC25A16P16260 332 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 GPX3P22352 226 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CDKN1AP38936 164 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 MAGEA3P43357 314 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PGGT1BP53609 377 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CLDN18P56856 261 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 HMGCS1Q01581 520 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CHRNB3Q05901 458 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 MORF4L2Q15014 288 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 LGSNQ5TDP6 509 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SSX8Q7RTT4 187 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CEP112Q8N8E3 955 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 HSD17B8Q92506 261 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 FIG4Q92562 907 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TMBIM1Q969X1 311 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SNX18Q96RF0 628 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 NODALQ96S42 347 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ITPAQ9BY32 194 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 OR10A4Q9H209 315 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 DSN1Q9H410 356 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ALG9Q9H6U8 611 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 FOLH1BQ9HBA9 442 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 TAS2R9Q9NYW1 312 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PLCE1Q9P212 2302 aa4.85□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 A0A0A6YYD5 115 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 HMX3A6NHT5 357 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PGRMC2O15173 223 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 DHHO43323 396 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 LMX1BO60663 402 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 UGDHO60701 494 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 KERAO60938 352 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 UGT2B11O75310 529 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 EEDO75530 441 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 BANF1O75531 89 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SEMA3DO95025 777 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CLDN9O95484 217 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 PLAUP00749 431 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 GBAP04062 536 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CSF3P09919 207 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 HPGDP15428 266 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CD1DP15813 335 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 CRABP2P29373 138 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 MPIP34949 423 aa4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC004825.1-201ENST00000555068 RFX3P48380 749 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms