RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 ASB5Q8WWX0 329 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 C3orf49Q96BT1 292 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ARL5BQ96KC2 179 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TM9SF2Q99805 663 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ARHGDIGQ99819 225 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ALG2Q9H553 416 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 RNF122Q9H9V4 155 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 STOML1Q9UBI4 398 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GJE1A6NN92 205 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SYT5O00445 386 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TNFSF13O75888 250 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 LGI1O95970 557 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 IL2RAP01589 272 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 BMP5P22003 454 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 COL8A1P27658 744 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SLC7A1P30825 629 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SGCBQ16585 318 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OSTF1Q92882 214 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR5B2Q96R09 309 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 DOCK7Q96N67 2140 aa14.65□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 A0A1B0GWA3 101 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 A0A1W2PNV4 684 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TNFRSF1BP20333 461 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 HTR1EP28566 365 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 HTR3AP46098 478 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CARD18P57730 90 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SLC25A3Q00325 362 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 BNIP2Q12982 314 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 MYBPHQ13203 477 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RNF128Q8TEB7 428 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.64□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PRSS44E7EML9 344 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FESP07332 822 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 C8BP07358 591 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 T-ENOLP0DO92 83 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TFPIP10646 304 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FCGR2AP12318 317 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CTSSP25774 331 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 KDELR2P33947 212 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CPOXP36551 454 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 DIO1P49895 249 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 COPZ1P61923 177 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RNF148Q8N7C7 305 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ABHD3Q8WU67 409 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CACNA1CQ13936 2221 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CXCR6O00574 342 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 DVL2O14641 736 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ZNF208O43345 1280 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SYNGR4O95473 234 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 IL18BPO95998 194 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 IMPDH2P12268 514 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 NCK1P16333 377 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ENPP1P22413 925 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RAC3P60763 192 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms