RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 RAD21L1Q9H4I0 556 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PRR14LQ5THK1 2151 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TMEM72A0PK05 275 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PRKD3O94806 890 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 THBS1P07996 1170 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ARAFP10398 606 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TFPIP10646 304 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CCNA2P20248 432 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 EDNRAP25101 427 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TACR3P29371 465 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SLC1A3P43003 542 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ADRM1Q16186 407 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GCNT6Q5T4J0 391 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ANKRD34AQ69YU3 496 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 STAC2Q6ZMT1 411 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 COMTD1Q86VU5 262 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SLC43A2Q8N370 569 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ADAM19Q9H013 955 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 RABEP2Q9H5N1 569 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 BCO1Q9HAY6 547 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GP6Q9HCN6 339 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TMED7Q9Y3B3 224 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ROS1P08922 2347 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 DEFB108AA8MXU0 73 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SULT2B1O00204 365 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 FRS3O43559 492 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CYTIPO60759 359 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PGM3O95394 542 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GUCY1A3Q02108 690 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SERPINA11Q86U17 422 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF440Q8IYI8 595 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 DPP10Q8N608 796 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SPATA9Q9BWV2 254 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 NDRG3Q9UGV2 375 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TRIM33Q9UPN9 1127 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 FREM1Q5H8C1 2179 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ITPR3Q14573 2671 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 RAMP1O60894 148 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 THBDP07204 575 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 YES1P07947 543 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GPX2P18283 190 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 HTR3AP46098 478 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SELPLGQ14242 412 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 RUNDC3AQ59EK9 446 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TMEM201Q5SNT2 666 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 BBS10Q8TAM1 723 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 MED18Q9BUE0 208 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 KLHL9Q9P2J3 617 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 MTORP42345 2549 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 TMEM247A6NEH6 219 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PMS2P2O95744 297 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 IMPDH2P12268 514 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 HOXC5Q00444 222 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CDK6Q00534 326 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 METTL21CQ5VZV1 264 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 IFT52Q9Y366 437 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF716A6NP11 495 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 FBP2O00757 339 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ZNF208O43345 1280 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 GOSR1O95249 250 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 ETS2P15036 469 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CRYGSP22914 178 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 LOXP28300 417 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 CLK1P49759 484 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-222ENST00000550996 IST1P53990 364 aa18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms